- Atatürk ve Cumhuriyet Dönemi Araştırma ve Uygulama Merkezi (ACDAM)
E-posta: acdam@bilkent.edu.tr
- Aysel Sabuncu Beyin Araştırmaları Merkezi (ASBAM)
Müdür: Hüseyin Boyacı
Tel: 0 312 290 1154
E-posta: ferdi.akkaya@bilkent.edu.tr
- Halil İnalcık Osmanlı Araştırmaları Merkezi (HİCOS)
Müdür: Mehmet Kalpaklı
Tel: 0 312 290 2386
E-posta: kalpakli@bilkent.edu.tr
- İnsan Hakları Çalışmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi (İHM)
Müdür: Ayşe Dicle Ergin
Tel: 0 312 290 3300
Faks: 0 312 266 4001
E-posta: ihm@bilkent.edu.tr, dicle.ergin@bilkent.edu.tr
- Nanoteknoloji Araştırma Merkezi (NANOTAM)
Müdür: Ekmel Özbay
Tel: 0 312 290 1966
E-posta: nanotechnology@bilkent.edu.tr
ozbay@bilkent.edu.tr
- Oğuz Tansel Türk Edebiyatı Uygulama ve Araştırma Merkezi (OTTEM)
Müdür: Mehmet Kalpaklı
Tel: 0 312 290 1056
Faks: 0 312 266 40 59
E-posta: ottem@bilkent.edu.tr
- Öğrenme ve Geliştirme Uygulama ve Araştırma Merkezi (BOGM)
Müdür: Erdal Erel
Tel: 0 312 2901882
E-posta: bogm@bilkent.edu.tr
- Ulusal Manyetik Rezonans Araştırma Merkezi (UMRAM)
Müdür: Tolga Çukur
Tel: 0 312 290 1154
Faks: 0 312 290 3001
E-posta: ferdi.akkaya@bilkent.edu.tr
- Ulusal Nanoteknoloji Araştırma Merkezi
Malzeme Bilimi ve Nanoteknoloji Enstitüsü (UNAM)
Müdür: Hilmi Volkan Demir
Tel: 0 312 290 2513
E-posta: unam@unam.bilkent.edu.tr